近年來，清水縣有序推進縣公立醫院綜合改革，全面實施藥品零差率銷售，逐步建立了維護公益性、調動積極性、保障可持續運行的公立醫院運行新機制。全力推進“健康清水”建設。
投資2.6億元實施縣醫院遷建工程，新改擴建鄉鎮衛生院11所，建成標準化村衛生室181個，積極推行分級診療，基本實現了“小病不出村、常見病不出鄉、大病縣能治。”
建全完善新型農村合作醫療運行機制，全面落實城鄉居民大病醫保制度，全縣新農合參合率達到98.46%,五年累計為19.15萬人報銷醫藥費4128.92萬元，平均住院報銷比例68.62%。
在精準扶貧工作開展中，清水縣根據縣情實際，將建檔立卡貧困戶門診慢性病由40種增加至65種，報銷比例由70%提高到90%。
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